Lactobacillus rhamnosus GG et Saccharomyces boulardii sont aujourd’hui les deux probiotiques les plus étudiés pour prévenir les déséquilibres intestinaux liés à la prise d’antibiotiques, en particulier la diarrhée associée aux antibiotiques (DAA). Bien qu’indispensables pour traiter certaines infections bactériennes, les antibiotiques ont aussi l’inconvénient d’altérer le microbiote intestinal (baisse de la diversité bactérienne, prolifération de pathogènes opportunistes favorisée, perturbation des fonctions de barrière de l’intestin). En complément d’une alimentation adaptée, les probiotiques sont maintenant reconnus pour contribuer à l’éviter par un effet protecteur bien documenté.

Cet article a été mis à jour le 05/02/2026

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Les probiotiques les plus étudiés

De nombreuses méta-analyses et revues systématiques montrent un intérêt pour les probiotiques dans la prévention de la diarrhée associée aux antibiotiques (DAA). Ces publications scientifiques ont même fait l’objet d’une analyse de l’Institut Cochrane qui a notamment conduit l’European Society for Pediatric Gastroenterology, Hepatology and Nutrition (ESPGHAN) à recommander depuis 2016 l’utilisation de L. rhamnosus et de S. boulardii pour la prévention des DAA chez l’enfant. Ces effets ont aussi été mis en évidence chez l’adulte.

  • Lactobacillus rhamnosus GG (LGG) est la souche bactérienne la mieux documentée dans ce contexte, chez l’adulte comme chez l’enfant. Les méta-analyses montrent une réduction significative du risque de diarrhée associée aux antibiotiques avec plusieurs mécanismes d’action complémentaires : adhésion à la muqueuse intestinale et effet barrière, inhibition de la croissance de bactéries pathogènes, modulation de la réponse immunitaire intestinale.
  • Saccharomyces boulardii (CNCM I-745) a fait l’objet d’études cliniques montrant une réduction significative du risque de DAA chez l’adulte et l’enfant. Elle présente aussi un effet préventif sur la diarrhée associée à Clostridioides difficile, avec un niveau de preuve plus modéré mais cohérent. Les recommandations de l’ESPGHAN soutiennent son utilisation chez l’enfant pour la prévention de la DAA et suggèrent son usage en prévention en cas de risque de diarrhée à C. difficile. Ses mécanismes d’action sont multiples : neutralisation de toxines, inhibition de l’adhésion des pathogènes, modulation immunitaire et soutien de l’intégrité de la barrière intestinale.

Comment les utiliser ?

Association de probiotiques conseillée :

La prévention des DAA est un domaine où les données scientifiques ont permis de mettre en évidence deux probiotiques bien identifiés à utiliser au choix : Lactobacillus rhamnosus GG ou Saccharomyces boulardii.

L’association de ces deux probiotiques est plutôt conseillée chez les personnes à risque élevé de DAA ou ayant des antécédents digestifs.

Par voie orale :
  • Sous forme de gélule gastro-résistante, prendre 10 à 15 milliards d’UFC (Unités Formant Colonies) de chaque souche par jour. Privilégier les sachets à disperser dans l’eau pour les enfants (sur avis médical).
  • À prendre à distance de l’antibiotique (au moins 2 heures lorsque cela est possible)..
  • Commencer dès le premier jour du traitement antibiotique et poursuivre 1 à 3 semaines après l’arrêt de l’antibiotique. Pas d’utilisation prolongée sans avis médical.
Critères de qualité :
  • Souches de probiotiques clairement identifiées et déposées dans une Biobanque : le produit doit indiquer clairement le genre, l’espèce et la souche de chaque probiotique. Par exemple, "Lactobacillus (genre) rhamnosus (espèce) GG (souche) déposée dans une Biobanque sous le nom ATCC53103".
  • Gélule gastro-résistante : il est préférable que les souches soient conditionnées dans des gélules gastro-résistantes pour limiter l’impact de l’acidité gastrique.
  • Titrage en UFC : la quantité de probiotiques doit être clairement précisée en UFC (Unités Formant Colonie) par gramme et par gélule.
Précautions d’emploi :
  • En tant que compléments alimentaires, les probiotiques doivent être utilisés dans le cadre d’un mode de vie sain et ne pas être utilisés comme substituts d’un régime alimentaire varié et équilibré.
  • Ne remplace pas un traitement anti-diarrhéique en cours sans avis médical.
  • Ne pas dépasser la dose journalière conseillée.
  • Déconseillé aux enfants de moins de 6 ans et tenir hors de la portée des jeunes enfants.
  • Demander conseil à un professionnel de santé avant utilisation pour les femmes enceintes ou allaitantes, ainsi que pour les personnes immunodéprimées.
  • À conserver dans un endroit sec, à l’abri de la lumière et de la chaleur.

Important : consulter rapidement un médecin en cas de diarrhée sévère ou persistante, de fièvre élevée ou de signes de déshydratation.

Autres extraits naturels complémentaires en cas de diarrhées et de gastro-entérite

Les probiotiques ont un intérêt pour prévenir les diarrhées associées aux antibiotiques. Ils peuvent par ailleurs être associés à d’autres solutions naturelles dans une approche globale visant à limiter le développement de pathogènes et à réguler le transit.

  • Les huiles essentiellesl’huile essentielle de Cannelle de Chine est une référence en aromathérapie en cas de diarrhée infectieuse, à condition de bien respecter ses précautions d’emploi.
  • Le Psyllium : riche en fibres solubles, le Psyllium est bénéfique en cas de diarrhées légères et modérées.
  • L’Argile Verte : la consommation d’Argile verte permet de réduire la durée des épisodes diarrhéiques et la fréquence des selles grâce à son pouvoir d’absorption de l’eau et d’adsorption des pathogènes. Elle peut être remplacée par l’Argile Blanche plus douce par voie orale.


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Bibliographie

Publication : Guo, Q., Goldenberg, J. Z., Humphrey, C., El Dib, R., & Johnston, B. C. (2019). Probiotics for the prevention of pediatric antibiotic-associated diarrhea. The Cochrane database of systematic reviews, 4(4), CD004827. https://doi.org/10.1002/14651858.CD004827.pub5

Publication : Hickson, M., D'Souza, A. L., Muthu, N., Rogers, T. R., Want, S., Rajkumar, C., & Bulpitt, C. J. (2007). Use of probiotic Lactobacillus preparation to prevent diarrhoea associated with antibiotics: randomised double blind placebo controlled trial. BMJ (Clinical research ed.), 335(7610), 80. https://doi.org/10.1136/bmj.39231.599815.55

Publication : Beausoleil, M., Fortier, N., Guénette, S., L'ecuyer, A., Savoie, M., Franco, M., Lachaine, J., & Weiss, K. (2007). Effect of a fermented milk combining Lactobacillus acidophilus Cl1285 and Lactobacillus casei in the prevention of antibiotic-associated diarrhea: a randomized, double-blind, placebo-controlled trial. Canadian journal of gastroenterology = Journal canadien de gastroenterologie, 21(11), 732–736. https://doi.org/10.1155/2007/720205

Publication : Liao, W., Chen, C., Wen, T., & Zhao, Q. (2021). Probiotics for the Prevention of Antibiotic-associated Diarrhea in Adults: A Meta-Analysis of Randomized Placebo-Controlled Trials. Journal of clinical gastroenterology, 55(6), 469–480. https://doi.org/10.1097/MCG.0000000000001464

Publication : Nel Van Zyl, K., Matukane, S. R., Hamman, B. L., Whitelaw, A. C., & Newton-Foot, M. (2022). Effect of antibiotics on the human microbiome: a systematic review. International journal of antimicrobial agents, 59(2), 106502. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2021.106502

Publication : Goodman, C., Keating, G., Georgousopoulou, E., Hespe, C., & Levett, K. (2021). Probiotics for the prevention of antibiotic-associated diarrhoea: a systematic review and meta-analysis. BMJ open, 11(8), e043054. https://doi.org/10.1136/bmjopen-2020-043054

Publication : Czerucka, D., & Rampal, P. (2019). Diversity of Saccharomyces boulardii CNCM I-745 mechanisms of action against intestinal infections. World journal of gastroenterology, 25(18), 2188–2203. https://doi.org/10.3748/wjg.v25.i18.2188

Ouvrage : Dr William Berrebi (2024). Médecine micro-biotique, votre nouvelle ordonnance pour être en bonne santé. Poche Marabout. Poche santé.

Ouvrage : Dr Daniel Sincholle (2023). Super microbiote, Le guide complet des prébiotiques et des probiotiques. Editions Thierry Souccar.

Site Web : Probiotique — Wikiphyto. (s. d.). https://www.wikiphyto.org/wiki/Probiotique

Site Web : Aegerter, V. A., & Bally, F. (2012, 10 octobre). Prévention et traitement des diarrhées dues aux antibiotiques : rôle des probiotiques. Revue Medicale Suisse. https://www.revmed.ch/revue-medicale-suisse/2012/revue-medicale-suisse-357/prevention-et-traitement-des-diarrhees-dues-aux-antibiotiques-role-des-probiotiques

Site Web : Captcha. (s. d.). https://www.sante.fr/decryptage/nos-reponses/les-probiotiques-sont-ils-utiles-lorsquon-prend-des-antibiotiques

Site Web : Allan, S. (2025, 8 décembre). Faut-il prendre des probiotiques pendant la prise d'antibiotiques ? Canadian Digestive Health Foundation. https://cdhf.ca/fr/faut-il-prendre-des-probiotiques-pendant-la-prise-dantibiotiques/

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