Les données sont encore limitées dans ce domaine, mais des probiotiques comme Lactobacillus casei ou Bifidobacterium infantis ont fait l’objet d’études avec des résultats prometteurs sur certains symptômes du syndrome de la fatigue chronique (ou encéphalomyélite myalgique). Si la fatigue est plutôt causée par à du stress ou un manque de sommeil, d’autres probiotiques comme Lactobacillus plantarum peuvent être utilisés compte tenu de ses effets sur l’axe intestin-cerveau. Selon les cas, la prise de probiotiques s’inscrit dans une prise en charge plus globale de la fatigue, pour s’assurer notamment que certains besoins nutritionnels sont bien couverts (ex : vitamine C et fer), pour mettre en place un mode de vie et des solutions anti-stress…
Cet article a été mis à jour le 02/12/2025
D’après les connaissances sur cette pathologie, les probiotiques pourraient contribuer à rétablir l’équilibre du microbiote qui est perturbé chez les personnes attentes d’encéphalomyélite myalgique ou syndrome de fatigue chronique (EM/SFC). Les résultats dans ce domaine sont encore limités, mais l'administration de Lactobacillus casei Shirota (ou Lacticaseibacilllus casei) chez des patients atteints du SFC, pendant 8 semaines, a permis de réduire l'anxiété.
Par ailleurs, un traitement à base de Bifidobacterium longum infantis 35624 a réduit les biomarqueurs inflammatoires. Enfin, une étude avec un mélange de probiotiques (Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus paracasei (ou Lacticaseibacillusparacasei subsp. Paracasei) et Bifidobacterium animalis lactis) a donné des résultats encourageants pour des personnes atteintes de SFC. Des recherches supplémentaires, axées sur d’autres symptômes de cette pathologie, sont encore nécessaires.
De plus en plus de recherches montrent que certains probiotiques peuvent influencer la régulation du stress et de l’anxiété, ou des troubles du sommeil en agissant à plusieurs niveaux de l’axe intestin-cerveau : régulation du cortisol (« hormone du stress »), production de neurotransmetteurs comme la sérotonine (« hormone du bonheur » régulatrice des émotions et de l’appétit), la mélatonine (« hormone du sommeil ») ou le GABA (« tranquillisant naturel »). En complément d’autres approches, ils peuvent ainsi contribuer à limiter la fatigue causée par le stress ou le manque de sommeil.
Par définition, les probiotiques sont des micro-organismes vivants (bactéries, levures…) exerçant un effet bénéfique sur l'organisme qui les ingère. Certaines sources mentionnent cependant que la prise de probiotiques, par une action de « détoxification », pourraient être à l’origine d’une fatigue temporaire. Il ne s’agit pour le moment que de théories, sans études scientifiques permettant de confirmer ce risque. Les données actuelles vont davantage en faveur d’effets positifs sur le système immunitaire ou la régulation de l’inflammation qui peuvent contribuer, au contraire, à réduire la fatigue.
Il est également recommandé d’introduire progressivement davantage de fibres prébiotiques dans son alimentation (nourriture des probiotiques), dans l’optique de limiter les ballonnements et de favoriser l’implantation ainsi que le développement des souches de probiotiques.
Toute fatigue anormale ou répétée nécessite un avis médical et un bilan de santé pour en identifier la cause. Selon les cas, plusieurs solutions naturelles ou micronutritionnelles pourront aider à se sentir moins fatigué :
Publication : Roman, P., Carrillo-Trabalón, F., Sánchez-Labraca, N., Cañadas, F., Estévez, A.F., & Cardona, D. (2018). Are probiotic treatments useful on fibromyalgia syndrome or chronic fatigue syndrome patients? A systematic review. Beneficial Microbes, 9(4), 603-612. https://doi.org/10.3920/BM2017.0125
Publication : König, R. S., Albrich, W. C., Kahlert, C. R., Bahr, L. S., Löber, U., Vernazza, P., ... & Forslund, S. K. (2022). The gut microbiome in myalgic encephalomyelitis (ME)/chronic fatigue syndrome (CFS). Frontiers in immunology, 12, 628741.
Publication : Jurek, J. M., & Castro-Marrero, J. (2024). A narrative review on gut microbiome disturbances and microbial preparations in myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome: implications for long COVID. Nutrients, 16(11), 1545.
Ouvrage : Dr Daniel Sincholle (2023). Super microbiote, Le guide complet des prébiotiques et des probiotiques. Editions Thierry Souccar.
Ouvrage : Dr William Berrebi (2024). Médecine micro-biotique, votre nouvelle ordonnance pour être en bonne santé. Poche Marabout. Poche santé.
Ouvrage : Gomez, P. F. J. (2016). L’intestin notre deuxième cerveau. Marabout.
Ouvrage : Lorrain, E. (2019). Grand manuel de phytothérapie
Ouvrage : Couic Marinier, F., & Touboul, A. (2017). Le guide Terre vivante des huiles essentielles. Terre Vivante Editions.
Ouvrage : Coudron C. & Pourrias B. (2014). Guides des ordonnances de nutrition. Editions de Santé.
Site Web : WikiPhyto, l’encyclopédie de la phytothérapie. (s. d.). à l’adresse http://www.wikiphyto.org/wiki/Accueil
Site Web : ANSES. Actualisation des repères du PNNS : révision des repères de consommations alimentaires. Rapport d’expertise collective. 2016.